ألا ميخينكو - MBZUAI MBZUAI

ألا ميخينكو

أستاذ مساعد في علم الأحياء الحاسوبي

الاهتمامات البحثية

تشمل اهتمامات البروفيسورة ميخينكو البحثية والتدريسية علم الأحياء الحاسوبي وعلوم الأعصاب. يهدف بحثها إلى تحسين فهم الآليات الجزيئية للتنكس العصبي باستخدام أساليب حاسوبية، بما يسهم في فهم أعمق لبيولوجيا الخلية وتنظيم التضفير. كما تعمل على تطوير أساليب حاسوبية تُستخدم على نطاق واسع، وتطبيقها على بيانات طبية حيوية متنوعة، بما في ذلك بيانات التسلسل الكلي وعلى مستوى الخلية الواحدة، بهدف تحديد الأشكال الإسوية المرضية والمسارات المرتبطة بالأمراض، وبناء نماذج تنبؤية تُسهم في توجيه الدراسات المستقبلية واكتشاف الأهداف العلاجية.

البريد الإلكتروني

inner_image

قبل انضمامها إلى جامعة محمد بن زايد للذكاء الاصطناعي، عملت البروفيسورة ميخينكو باحثة ما بعد الدكتوراه في كلية لندن الجامعية، حيث استخدمت أساليب حاسوبية لدراسة الأمراض التنكسية العصبية بالاعتماد على بيانات متعددة الأنماط واسعة النطاق، بهدف تحديد مؤشرات حيوية جديدة وأهداف علاجية. حصلت على درجة الدكتوراه في المعلوماتية الحيوية عام 2021 من مركز التقانة الحيوية الخوارزمية في جامعة سانت بطرسبرغ الحكومية. كما تشمل أعمالها السابقة تطوير أدوات مستخدمة على نطاق واسع لتحليل بيانات الجينوم والنسخ والبروتينات. وشاركت كعضو في اتحاد "من التيلومير إلى التيلومير" في إنجاز أول تجميع كامل للجينوم البشري.

  • باحثة ما بعد الدكتوراه، كلية لندن الجامعية، المملكة المتحدة
  • دكتوراه في المعلوماتية الحيوية، جامعة سانت بطرسبرغ الحكومية، روسيا
  • دكتور في الطب، جامعة أوليانوفسك الحكومية، روسيا
  • برنامج البرمجيات مفتوحة المصدر الأساسية للعلوم، مبادرة تشان زوكربيرغ، عام 2021
  • جائزة العلماء الشباب، جامعة سانت بطرسبرغ الحكومية، عام 2019
  • منحة سفر المؤتمر الأوروبي لعلم الأحياء الحاسوبي، عام 2015

  • دراسة بعنوان: Accurate isoform discovery with IsoQuant using long reads، قام بإعدادها كل من A. D. Prjibelski، A. Mikheenko، A. Joglekar وآخرين، نُشرت في دورية "Nature Biotechnology"، عام 2023.
  • دراسة بعنوان: WebQUAST: online evaluation of genome assemblies، قام بإعدادها كل من A. Mikheenko، V. Saveliev، P. Hirsch، A. Gurevich، نُشرت في دورية "Nucleic Acids Research"، عام 2023.
  • دراسة بعنوان: Sequencing of individual barcoded cDNAs using Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies reveals platform-specific error patterns، قام بإعدادها كل من A. Mikheenko، A. D. Prjibelski، A. Joglekar، H. Tilgner، نُشرت في دورية "Genome Research"، عام 2022.
  • دراسة بعنوان: Fast and accurate mapping of long reads to complete genome assemblies with VerityMap، قام بإعدادها كل من A. V. Bzikadze، A. Mikheenko، P. A. Pevzner، نُشرت في دورية "Genome Research"، عام 2022.
  • دراسة بعنوان: The complete sequence of a human Y chromosome، قام بإعدادها كل من A. Rhie، S. Nurk، M. Cechova، A. Mikheenko وآخرين، نُشرت في دورية "Nature"، عام 2023.
  • دراسة بعنوان: Single-nuclei isoform RNA sequencing unlocks barcoded exon connectivity in frozen brain tissue، قام بإعدادها كل من S. A. Hardwick، W. Hu، A. Joglekar، A. Mikheenko وآخرين، نُشرت في دورية "Nature Biotechnology"، عام 2022.
  • دراسة بعنوان: The complete sequence of a human genome، قام بإعدادها كل من S. Nurk، S. Koren، A. Rhie، A. Mikheenko وآخرين، نُشرت في دورية "Science"، عام 2022.
  • دراسة بعنوان: TandemTools: mapping long reads and assessing/improving assembly quality in extra-long tandem repeats، قام بإعدادها كل من A. Mikheenko، A. V. Bzikadze، A. Gurevich، K. H. Miga، P. A. Pevzner، نُشرت في دورية "Bioinformatics"، عام 2020.
  • دراسة بعنوان: Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG، قام بإعدادها كل من A. Mikheenko، A. Prjibelski، V. Saveliev، D. Antipov، A. Gurevich، نُشرت في دورية "Bioinformatics"، عام 2018.
  • دراسة بعنوان: Assembly Graph Browser: interactive visualization of assembly graphs، قام بإعدادها كل من A. Mikheenko، M. Kolmogorov، نُشرت في دورية "Bioinformatics"، عام 2018.
  • دراسة بعنوان: Increased diversity of peptidic natural products revealed by modification-tolerant database search of mass spectra، قام بإعدادها كل من A. Gurevich، A. Mikheenko، A. Shlemov وآخرين، نُشرت في دورية "Nature Microbiology"، عام 2018.
  • دراسة بعنوان: MetaQUAST: evaluation of metagenome assemblies، قام بإعدادها كل من A. Mikheenko، V. Saveliev، A. Gurevich، نُشرت في دورية "Bioinformatics"، عام 2016.

تواصل مع شئون الكلية

مهتم بالعمل مع أعضاء هيئة التدريس لدينا
قم بتعبئة النموذج أدناه وسنقوم بالرد عليك.